La Institución Educativa Departamental Rural «María Auxiliadora», tiene como misión formar estudiantes desde el nivel preescolar que ante situaciones problemas de la vida escolar y cotidiana sean capaces de plantear de forma creativa y crítica alternativas de solución; personas íntegras que puedan desenvolverse en una sociedad tan cambiante como la de hoy, haciendo énfasis en el sentido de pertenencia hacia la Institución Educativa y su entorno social, despertando en los mismos expectativas de trabajo, creando de esta forma puentes que le permitan a través de la realización de proyectos productivos auto sostenibles oportunidades de empleo.
A su vez se busca que el estudiante posea y domine conocimientos para que pueda ingresar fácilmente a los estudios superiores y que le permitan competir con ética en el campo laboral y social.
Así mismo se busca que la comunidad educativa en cuanto a los padres de familia, acudientes y ex-alumnos, aprovechen los espacios que le brinda la Institución, con el ánimo de contribuir en la toma de decisiones que encaminen el mejoramiento del proceso de desarrollo humano, buscando de manera dinámica el rescate de los valores que permitan construir una sociedad más justa y tolerante.